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目前報(bào)導(dǎo)的“m5C”位點(diǎn)往往成簇存在于高GC含量區(qū)域，對針對NSUN2的RNA干擾不敏感，也無法被m5C抗體所富集，極可能是實(shí)驗(yàn)引入的假陽性。根據(jù)這一特征，該研究建立了一套新穎的生物信息學(xué)計(jì)算流程過濾噪音，得以精確地定位mRNA上的m5C。通過進(jìn)一步分析，該研究發(fā)現(xiàn)NSUN2依賴的m5C位點(diǎn)傾向于擁有一個(gè)3’富G的基序，通常位于在一個(gè)小頸環(huán)結(jié)構(gòu)的底部，與其tRNA底物高度一致，揭示了mRNA m5C 序列和結(jié)構(gòu)特征的由來。該研究發(fā)現(xiàn)除了NSUN2，NSUN家族其他成員不調(diào)控mRNA m5C位點(diǎn)，暗示除了NSUN家族成員，可能存在新的甲基轉(zhuǎn)移酶參與了不依賴于NSUN2 的mRNA m5C位點(diǎn)的催化。通過進(jìn)一步對7個(gè)人類組織于10個(gè)小鼠組織的轉(zhuǎn)錄組測序分析，分別確認(rèn)了3212與2498個(gè)高置信度位點(diǎn)。結(jié)果表明，在不同組織中mRNA m5C位點(diǎn)的數(shù)量與甲基化水平有很大差異。在人和小鼠的睪丸、肝臟、心肌和骨骼肌，mRNA上有數(shù)百個(gè)高置信度的m5C位點(diǎn)，而在其他的一些組織則寥寥可數(shù)。另外，這些m5C位點(diǎn)在人和老鼠之間并不保守，說明它們很可能是受到順式調(diào)控（cis-regulation）的。       這項(xiàng)研究開發(fā)的方法為mRNA m5C的研究提供了新的工具；其構(gòu)建的哺乳動物mRNA m5C 精確圖譜為發(fā)現(xiàn)mRNA上m5C修飾的調(diào)控和功能奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。奧地利因斯布魯克醫(yī)科大學(xué)Alexandra Lusser教授在同期撰寫的評述文章“Getting a hold on cytosine methylation in mRNA”中，評價(jià)張銳教授課題組開發(fā)的新計(jì)算方法增加了m5C檢測的精確度，進(jìn)一步提供了tRNA甲基化轉(zhuǎn)移酶NSUN2介導(dǎo)mRNA甲基化的令人信服的證據(jù)。

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一周高等教育科技創(chuàng)新政策、熱點(diǎn)新聞導(dǎo)讀

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