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一種估計(jì)基因組育種值的方法及裝置
本發(fā)明實(shí)施例提供一種估計(jì)基因組育種值的方法及裝置，該方法包括：根據(jù)矩陣M?1的子塊數(shù)和預(yù)設(shè)的MPI進(jìn)程數(shù)n，確定MPI進(jìn)程MPIi讀取的根據(jù)表型數(shù)據(jù)文件的記錄條數(shù)、矩陣A?1中的個(gè)體數(shù)和所述MPI進(jìn)程數(shù)n，確定MPI進(jìn)程MPIi讀取的系數(shù)矩陣Wi和根據(jù)MPI進(jìn)程MPIi的系數(shù)矩陣Wi和確定待估計(jì)的基因組育種值。本發(fā)明實(shí)施例可以實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)資源與運(yùn)算速度的最優(yōu)化，節(jié)約運(yùn)算時(shí)間，提高工作效率。
中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-11
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一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應(yīng)用
項(xiàng)目成果/簡(jiǎn)介:本發(fā)明公開(kāi)了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補(bǔ)的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標(biāo)記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記,可以迅速鑒定小麥?zhǔn)欠駷樗氚l(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-10
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基因放療引起放射性腦損傷相關(guān)SNP標(biāo)志物
放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴(yán)重的晚期不良反應(yīng)之 放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴(yán)重的晚期不良反應(yīng)之 一。該不良反應(yīng)往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質(zhì)量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 一。該不良反應(yīng)往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質(zhì)量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 難，因此，對(duì)接受放療的鼻咽癌患者進(jìn)行放射性腦損傷發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)，對(duì)高危個(gè)體提前采取針對(duì)性的保護(hù)措施，實(shí)現(xiàn)腫瘤的個(gè)體化治療，顯得尤為重要。 本發(fā)明公開(kāi)了DISC1FP1基因上的SNP位點(diǎn)rs10501719作為與腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相 關(guān)的標(biāo)志物的應(yīng)用。同時(shí)，制備得到一種預(yù)測(cè)腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的試劑盒，利用該試 劑盒檢測(cè)SNP標(biāo)志物分型，聯(lián)合患者臨床信息可以更加全面準(zhǔn)確的評(píng)估鼻咽癌患者發(fā)生放射性腦損傷的患 病風(fēng)險(xiǎn)。
中山大學(xué)
2021-04-10
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SARS-CoV-2基因組分析進(jìn)化和起源的研究
2020年3月8日，安徽師范大學(xué)在bioRxiv上上傳了一篇題為Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10個(gè)新測(cè)序的SARS-CoV-2基因組，并結(jié)合GISAID數(shù)據(jù)庫(kù)中的136個(gè)基因組，通過(guò)不同的分析方法（如EBSP、錯(cuò)配和中性檢測(cè)等）研究前三個(gè)月數(shù)據(jù)的遺傳變異和統(tǒng)計(jì)。 結(jié)果顯示80個(gè)單倍型共有183個(gè)突變位點(diǎn)，包括27個(gè)簡(jiǎn)約性信息位點(diǎn)和156個(gè)單一位點(diǎn)。對(duì)遺傳多樣性的滑動(dòng)窗口分析表明，SARS-CoV-2基因組豐度的變化有一定范圍，這可以解釋目前這種病毒的廣泛和高適應(yīng)性。遺傳學(xué)分析不支持穿山甲是中間宿主。在最初的單倍型（H14）中，一個(gè)患者樣本居住在華南海鮮市場(chǎng)附近（約2公里），這表明患者有無(wú)意識(shí)接觸該市場(chǎng)史的可能性很高。然而，基于這個(gè)線索，也無(wú)法準(zhǔn)確斷定這個(gè)市場(chǎng)是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，從這個(gè)市場(chǎng)收集的16個(gè)基因組，包含10個(gè)單倍型，表明市場(chǎng)在短期內(nèi)出現(xiàn)循環(huán)感染，這可能導(dǎo)致武漢和其他地區(qū)爆發(fā)SARS-CoV-2。EBSP結(jié)果顯示，第一個(gè)估計(jì)的擴(kuò)展日期從2019年12月7日開(kāi)始，這表明SARS-CoV-2的傳染可能在11月中下旬開(kāi)始。
安徽師范大學(xué)
2021-04-10
一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應(yīng)用
本發(fā)明公開(kāi)了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補(bǔ)的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標(biāo)記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記,可以迅速鑒定小麥?zhǔn)欠駷樗氚l(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-29
VvSUC27基因在促進(jìn)植物攝取外界蔗糖中的應(yīng)用
本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，具體公開(kāi)了VvSUC27基因(GenBank登錄號(hào)：AF021810)在促進(jìn)植物攝取外界蔗糖中的應(yīng)用以及其在促進(jìn)植物生長(zhǎng)(尤其是在弱光環(huán)境或無(wú)光環(huán)境中生長(zhǎng))中的應(yīng)用。本發(fā)明通過(guò)過(guò)表達(dá)VvSUC27基因，促進(jìn)了植物攝取外界蔗糖，同時(shí)可使轉(zhuǎn)基因植物出現(xiàn)快速生長(zhǎng)的表型，并且可以在微光甚至使無(wú)光下快速生長(zhǎng)，證實(shí)了該基因的一個(gè)新的功能應(yīng)用。VvSUC27基因的克隆和轉(zhuǎn)基因的應(yīng)用，有望應(yīng)用于肉質(zhì)根或塊根植物及花卉等植物的培育中，使得植物即使在無(wú)光下也能快速生長(zhǎng)，有利于節(jié)約光能減少能源的浪費(fèi)。
中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-11
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預(yù)測(cè)重型肝炎病情基因的甲基化檢測(cè)方法及試劑
本發(fā)明涉及預(yù)測(cè)重型肝炎病情基因的甲基化狀態(tài)檢測(cè)的方法及試劑，提取病人外周血單個(gè)核細(xì)胞 DNA 進(jìn)行亞硫酸氫鹽修飾后，分別用谷胱甘 肽 S-轉(zhuǎn)移酶 M3 甲基化（M）特異性和非甲基化（U）特異性引物對(duì)進(jìn)行甲基化 特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)，根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物判斷其甲基化狀態(tài)，有助于臨床醫(yī)生判 定重型肝炎患者的病情和指導(dǎo)治療。
山東大學(xué)
2021-04-13
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創(chuàng)制轉(zhuǎn)基因技術(shù)中帶有安全篩選標(biāo)記的安全轉(zhuǎn)化載體
選擇標(biāo)記轉(zhuǎn)基因作物已成為近年來(lái)植物基因工程技術(shù)研究的重 點(diǎn)之一，隨著轉(zhuǎn)基因作物產(chǎn)品的商品化，轉(zhuǎn)基因植物的生物安全性受 到公眾越來(lái)越多的關(guān)注，尤其是目前抗生素標(biāo)記基因在植物遺傳轉(zhuǎn)化 過(guò)程中的廣泛應(yīng)用，使人們對(duì)這些標(biāo)記基因可能帶來(lái)的潛在危害性心 存疑慮，抗性標(biāo)記基因的存在嚴(yán)重地阻礙了轉(zhuǎn)基因植物的商品化進(jìn)程 和轉(zhuǎn)化技術(shù)本身的有效性。 本項(xiàng)目培育的無(wú)抗生素標(biāo)記基因（可視化標(biāo)記基因）在建立高效、 安全、規(guī)模化的轉(zhuǎn)基因作物技術(shù)體系方面取得突破，以紫色幼芽作為 沙 門(mén) 屎 腸 副溶血弧 霍 亂 小 腸 結(jié) 腸 親水氣單 糞 腸 金 黃 色 肺炎克雷 鉤端螺 嗜 肺 軍 志 賀 綠 膿可視篩選標(biāo)記代替抗生素篩選標(biāo)記，構(gòu)建了新型轉(zhuǎn)化載體并應(yīng)用于作 物，已申請(qǐng) 2 項(xiàng)發(fā)明專(zhuān)利。
南開(kāi)大學(xué)
2021-04-13
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基因轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合體形成及作用機(jī)制的研究
近日，東南大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院“發(fā)育與疾病相關(guān)基因”教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室林承棋和羅卓娟課題組在國(guó)際頂級(jí)期刊《Science Advances》雜志發(fā)表了題為ENL initiates multivalent phase separation of the Super Elongation Complex (SEC) in controlling rapid transcriptional activation的文章，闡明了有關(guān)基因轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合體形成及作用機(jī)制的研究工作成果。東南大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)的研究揭示了SEC介導(dǎo)的多價(jià)相分離在RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄暫停釋放中起著關(guān)鍵作用，并從全新的角度為基因快速協(xié)調(diào)性轉(zhuǎn)錄激活程序的機(jī)制探索提供了新的認(rèn)識(shí)。
東南大學(xué)
2021-04-11
業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
口蹄疫與偽狂犬病二價(jià)基因工程疫苗
研發(fā)階段/n口蹄疫（FMD）是引起的人及偶蹄動(dòng)物共患的一種烈急性、高度接觸性、發(fā)熱性傳染病。FMD在世界上許多國(guó)家流行，造成重大的經(jīng)濟(jì)損失和政治影響。口蹄疫病毒（FMDV）屬于小RNA病毒科（Picornaviridae），口蹄疫病毒屬（Aphthovirus），該病毒為單股正鏈小RNA病毒，基因組長(zhǎng)約8500個(gè)核苷酸，主要由結(jié)構(gòu)基因（P1區(qū)）和非結(jié)構(gòu)基因（P2、P3區(qū)）等構(gòu)成。該發(fā)明具體涉及一種新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重組偽狂犬病弱毒疫苗株，該毒株屬于豬偽狂犬病毒：Pseudorabi
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-01-12