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RNA修飾m6A單基因單堿基檢測(cè)新技術(shù)
（ i ）能夠阻礙 DNA 聚合酶在反轉(zhuǎn)錄過(guò)程的單堿基延伸；（ ii ）能夠降低缺口連接酶的連接效率。 SELECT 方法采用熒光定量 PCR 的方法進(jìn)行定量。結(jié)合方法優(yōu)化，發(fā)展了 SELECT 方法的 3 個(gè)應(yīng)用實(shí)例：（ i ）在生物學(xué)樣本總 RNA 或總 mRNA 中檢測(cè) mRNA 或 lncRNA 上單位點(diǎn)是否含有 m6A 修飾；（ ii ）檢測(cè)生物學(xué)樣本中特定 m6A 位點(diǎn)的修飾比例；（ iii ）鑒定 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶或去甲基酶的生理作用靶點(diǎn)。 SELECT 方法不僅簡(jiǎn)化了生物學(xué)樣品中 m6A 修飾的檢測(cè)過(guò)程，實(shí)現(xiàn)低豐度 RNA 中 m6A 單堿基分辨率的檢測(cè)，還能夠應(yīng)用于其他 RNA 化學(xué)修飾的檢測(cè)中，例如 N1- 甲基腺嘌呤（ N1-methyladenosine ， m1A ）和 2’-O- 甲基化修飾（ 2’-O-methylation ， Nm) 等。
北京大學(xué)
2021-04-11
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基于細(xì)長(zhǎng)反應(yīng)腔的全基因組擴(kuò)增方法
本發(fā)明提出了一種基于細(xì)長(zhǎng)反應(yīng)腔的全基因組擴(kuò)增方法，其特征在于將多重鏈置換擴(kuò)增反應(yīng)體系注入細(xì)長(zhǎng)型的反應(yīng)腔中，完成對(duì)目標(biāo)基因組的全基因組擴(kuò)增。細(xì)長(zhǎng)形的反應(yīng)腔體將多重鏈置換擴(kuò)增反應(yīng)體系相對(duì)分隔于一個(gè)細(xì)長(zhǎng)的反應(yīng)腔中，各微觀反應(yīng)單元之間的物質(zhì)交換和相互影響大為減少，因此各微觀反應(yīng)單元以一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的狀態(tài)發(fā)生反應(yīng)，目標(biāo)核酸各個(gè)片段之間的擴(kuò)增一致性得到很大提升。同時(shí)，基于細(xì)長(zhǎng)反應(yīng)腔的多重鏈置換擴(kuò)增，不需要預(yù)先制備微液滴發(fā)生裝置或復(fù)雜反應(yīng)微腔，并且在系統(tǒng)調(diào)試和擴(kuò)增反應(yīng)的過(guò)程中，不需要對(duì)微量液體進(jìn)行精密和復(fù)雜的控制，
東南大學(xué)
2021-01-12
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闡明了紅樹(shù)基因組水平的趨同進(jìn)化機(jī)制
紅樹(shù)植物是生長(zhǎng)在海岸潮間帶環(huán)境的木本植物，包含了不同分類(lèi)類(lèi)群的數(shù)十個(gè)物種，是研究適應(yīng)性趨同進(jìn)化的極佳對(duì)象。課題組選擇了三個(gè)主要的紅樹(shù)植物類(lèi)群共16種代表性的紅樹(shù)物種，進(jìn)行了全基因組或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序組裝，在全基因組水平檢測(cè)趨同進(jìn)化。通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)三個(gè)紅樹(shù)植物類(lèi)群起源的時(shí)間十分接近，共同經(jīng)歷了歷史上海平面的升降，并逐步適應(yīng)潮間帶環(huán)境。論文進(jìn)一步發(fā)展了準(zhǔn)確估計(jì)分子水平趨同進(jìn)化的方法，以陸生植物為對(duì)照，通過(guò)檢測(cè)趨同氨基酸替代的方法，成功收集到70多個(gè)在紅樹(shù)植物中趨同進(jìn)化的基因。此外還發(fā)現(xiàn)紅樹(shù)植物更多的趨同進(jìn)化發(fā)生在氨基酸組成和氨基酸替代模式的改變。相比于陸生植物，紅樹(shù)植物趨同地改變了9種氨基酸的使用頻率，更多地發(fā)生了平常少見(jiàn)的氨基酸替代模式。這種氨基酸組成的趨同進(jìn)化有助于紅樹(shù)植物適應(yīng)高鹽、動(dòng)蕩且營(yíng)養(yǎng)貧瘠的海岸潮間帶環(huán)境。這項(xiàng)研究通過(guò)合適的物種選取、大量的基因組數(shù)據(jù)和完備的對(duì)照組設(shè)置，首次真正在基因組水平上準(zhǔn)確地檢測(cè)出趨同氨基酸替代位點(diǎn)。
中山大學(xué)
2021-04-13
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一種基因工程熱穩(wěn)定疫苗及其制備方法
本發(fā)明公開(kāi)一種制備熱穩(wěn)定疫苗的方法，特別涉及一種聯(lián)合使用基因工程和仿生礦化技術(shù)制備熱穩(wěn)定疫苗的方法。本發(fā)明提供一種利用基因工程技術(shù)在疫苗表面引入具有誘導(dǎo)無(wú)機(jī)物礦化能力的多肽的方法；(1)構(gòu)建疫苗的基因克隆；(2)將多肽的核酸序列插入疫苗基因克隆中，得到重組克隆；(3)將重組克隆在細(xì)胞或大腸桿菌內(nèi)表達(dá)，得到具有自礦化能力的疫苗。本發(fā)明還一種制備鈣礦化上述制得的具有自礦化能力的疫苗的方法；(1)向有酸根的疫苗液加入Ca2+離子；(2)將體系進(jìn)行孵育，獲得磷酸鈣包被疫苗。本發(fā)明通過(guò)疫苗礦化，高效地解決了疫苗運(yùn)輸和保存中的熱失活現(xiàn)象，顯著降低疫苗的財(cái)政支出，在新型熱穩(wěn)定疫苗生產(chǎn)中有很好的應(yīng)用。
浙江大學(xué)
2021-04-13
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人類(lèi)周?chē)窠?jīng)發(fā)作性疼痛致病基因及其編碼蛋白
本發(fā)明提供了一種變異的 SCN11A 基因，即人類(lèi)周?chē)窠?jīng)發(fā)作性疼痛致病基因 SCN11A，其特征在于該變異的 SCN11A 基因的第 673位堿基由野生型的 C 變異為 T；或該變異的 SCN11A 基因的第 2423位堿基由野生型的 C 變異為 G。本發(fā)明還提供了一種檢測(cè)來(lái)源于人體生物樣本中是否存在所述基因的突變方法及檢測(cè)試劑盒。本發(fā)明提供的變異的人類(lèi) SCN11A 基因可用于制備人類(lèi)周?chē)窠?jīng)發(fā)作性疼痛基因診斷芯片，變異的人類(lèi) SCN11A 基因所編碼的蛋白質(zhì)可作為治療人類(lèi)周?chē)窠?jīng)發(fā)作性疼痛的藥
華中科技大學(xué)
2021-04-14
業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
優(yōu)質(zhì)健康豬重要候選基因挖掘分子育種標(biāo)記技術(shù)
可以量產(chǎn)/n1.構(gòu)建了豬基因素材的高效挖掘平臺(tái)與分子育種標(biāo)記開(kāi)發(fā)技術(shù)體 系。率先設(shè)計(jì)、建立了豬第一代寡核苷酸基因芯片的技術(shù)操作流程；優(yōu) 化了豬基因芯片的非特異過(guò)濾方法；開(kāi)發(fā)了豬 CRISPA/Cas9 基因組編輯 系統(tǒng)的 sgRNA 設(shè)計(jì)及脫靶效應(yīng)評(píng)估軟件獲得軟件著作權(quán)，創(chuàng)建了多個(gè)病 毒和細(xì)菌刺激的細(xì)胞和活體模型，發(fā)展了多個(gè)基因組學(xué)技術(shù)，實(shí)現(xiàn)了豬 基因素材高效挖掘平臺(tái)與分子育種標(biāo)記開(kāi)發(fā)技術(shù)體系的構(gòu)建。2.開(kāi)發(fā)了 10 個(gè)用于優(yōu)質(zhì)健康豬培育、具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的分子育種 標(biāo)記。篩選出豬重要
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-01-12
轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)棉新品種華雜棉H318
可以量產(chǎn)/n華雜棉H318是以陸地棉B0011品系為母本，轉(zhuǎn)Bt/CpTI雙價(jià)抗蟲(chóng)基因陸地棉4-5品系為父本，進(jìn)行人工去雄雜交配制的雜種一代優(yōu)勢(shì)組合。2009年通過(guò)國(guó)家審定，同時(shí)獲得農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物生產(chǎn)應(yīng)用安全證書(shū)。該品種的主要特點(diǎn)：產(chǎn)量高：兩年長(zhǎng)江區(qū)試結(jié)果表現(xiàn)為子棉、皮棉和霜前皮棉畝產(chǎn)分別為246.3kg/666.7m2、101.9kg/666.7m2、95.5kg/666.7m2，分別為對(duì)照湘雜棉8號(hào)的104.7%、109.7%、110.5%；纖維品質(zhì)優(yōu)良：試驗(yàn)統(tǒng)一送樣測(cè)試，長(zhǎng)度30.3毫米，斷裂
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-01-12
癌細(xì)胞簡(jiǎn)化自身基因組冗余序列以便快速增殖
核糖體DNA編碼核糖體的關(guān)鍵組分-核糖體RNA，對(duì)蛋白質(zhì)翻譯和細(xì)胞增殖具有重要的作用。然而，核糖體DNA的拷貝數(shù)在人類(lèi)基因組中是易變的，由于技術(shù)手段的限制，人們對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞如何維持和控制核糖體DNA的拷貝數(shù)和穩(wěn)定性所知甚少。本研究應(yīng)用計(jì)算生物學(xué)和數(shù)字微滴式PCR（Droplet digital PCR）方法分析了正常和癌癥狀態(tài)下，人類(lèi)和小鼠基因組中核糖體DNA的拷貝數(shù)和序列變異情況。發(fā)現(xiàn)人類(lèi)癌癥基因組中核糖體DNA拷貝數(shù)出乎意料地顯著減少，并伴隨許多其他基因拷貝數(shù)的變異。此外，癌癥基因組的核糖體DNA序列也更易發(fā)生突變。 根據(jù)文獻(xiàn)證據(jù)的提示，研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步探討了癌癥模型中mTOR（哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白，mammalian target of rapamycin）功能與核糖體DNA拷貝數(shù)減少的關(guān)系。發(fā)現(xiàn)Pten基因（mTOR信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控因子）敲除的白血病小鼠模型中，癌癥造血干細(xì)胞早期就出現(xiàn)核糖體DNA拷貝數(shù)的減少，但其細(xì)胞增殖、核糖體RNA合成和蛋白翻譯水平等均顯著提高。說(shuō)明核糖體DNA拷貝數(shù)丟失是mTOR通路過(guò)表達(dá)的癌癥的一種常見(jiàn)特征。這一研究結(jié)果提示，測(cè)定核糖體DNA拷貝數(shù)，可成為預(yù)測(cè)癌癥對(duì)DNA損傷藥物敏感性的一個(gè)簡(jiǎn)單而有效的新指標(biāo)。
中山大學(xué)
2021-04-13
蒙古大學(xué).jpg){kind=logo}
王國(guó)俊研究員與合作團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)現(xiàn)病毒編碼蛋白新機(jī)制:病毒基因與人類(lèi)基因融合產(chǎn)生新型嵌合蛋白
RNA病毒一直給人類(lèi)健康帶來(lái)巨大威脅。分節(jié)段負(fù)鏈RNA病毒（sNSV）通過(guò)自身攜帶的RNA聚合酶搶奪宿主細(xì)胞mRNA的5’端帽子結(jié)構(gòu)，轉(zhuǎn)錄為病毒mRNA，合成的病毒mRNA是由宿主基因和病毒基因組成的嵌合mRNA。此過(guò)程被稱(chēng)為“Cap-snatching”，是sNSV復(fù)制周期中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。 一直以來(lái)，人們認(rèn)為：病毒mRNA翻譯的蛋白只包含病毒基因的開(kāi)放閱讀框（ORF），宿主來(lái)源的mRNA序列的作用是其5’端帽子結(jié)構(gòu)可供宿主細(xì)胞翻譯體系識(shí)別，其他宿主源遺傳信息沒(méi)有合成病毒蛋白的功能。 該研究揭示了病毒編碼蛋白的新機(jī)制。 研究發(fā)現(xiàn)，病毒搶奪過(guò)來(lái)的宿主源mRNA片段，不僅起到5’端帽子結(jié)構(gòu)的作用，而且這些宿主源mRNA片段包括起始密碼子（AUG），宿主細(xì)胞可以從宿主的AUG開(kāi)始翻譯，編碼兩類(lèi)宿主與病毒的嵌合蛋白。若宿主源AUG與原有病毒蛋白ORF在同一讀碼框中（in-frame），產(chǎn)生的蛋白為 N 端延長(zhǎng)的宿主與病毒嵌合蛋白； 若宿主源AUG與原有病毒蛋白ORF不在同一讀碼框中（off-frame），產(chǎn)生的蛋白為新型的嵌合蛋白（Novel host-virus encoded proteins）。 進(jìn)一步研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)：流感病毒感染細(xì)胞后可以產(chǎn)生上述兩類(lèi)嵌合蛋白，這些嵌合蛋白可以誘導(dǎo)T細(xì)胞反應(yīng)，并且與病毒的毒力相關(guān)。該研究提示，這種新的病毒蛋白編碼機(jī)制可能不僅僅局限于流感病毒，在其他人類(lèi)病毒、動(dòng)物病毒和植物病毒中也廣泛存在這種宿主與病毒嵌合蛋白的編碼機(jī)制。 本研究是由美國(guó)紐約西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院（Icahn School of Medicine at Mount Sinai）牽頭，多國(guó)科研工作者共同合作完成。
內(nèi)蒙古大學(xué)
2021-02-01
農(nóng)業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
轉(zhuǎn)基因小鼠骨骼肌營(yíng)養(yǎng)不良模型的構(gòu)建方法
本發(fā)明提供一種轉(zhuǎn)基因小鼠骨骼肌營(yíng)養(yǎng)不良模型的構(gòu)建方法，其是利用Tet?on系統(tǒng)與轉(zhuǎn)基因技術(shù)構(gòu)建可以在肌肉內(nèi)特異性誘導(dǎo)表達(dá)microRNA29a和microRNA29b1的轉(zhuǎn)基因小鼠，可作為人Ullrich型先天性肌營(yíng)養(yǎng)不良的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型，與Ullrich型先天性肌營(yíng)養(yǎng)不良的表現(xiàn)相同，本發(fā)明構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型在生長(zhǎng)過(guò)程中也存在嚴(yán)重的呼吸問(wèn)題，約17％的小鼠會(huì)在斷乳前由于呼吸障礙而死亡，全部轉(zhuǎn)基因鼠會(huì)出現(xiàn)骨骼肌發(fā)育不良，為人Ullrich型先天性肌營(yíng)養(yǎng)不良的治療與研究提供了有力的工具。
中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-11