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生命科學學院韓管助課題組在逆轉錄病毒基因選配研究取得重要進展
逆轉錄病毒需要整合到宿主基因組中來完成自身的復制。當逆轉錄病毒感染宿主生殖細胞時，整合的逆轉錄病毒便會從親代傳到子代，從而形成內源性逆轉錄病毒。內源性逆轉錄病毒廣泛存在于脊椎動物基因中。絕大多數的內源性逆轉錄病毒會積累各種突變，從而在宿主基因組中失活或片段化。宿主有時會利用內源性逆轉錄病毒基因來行使自身生物學功能（圖1），這個過程在進化生物學中被稱為選配（co-option）。例如，抑制多種逆轉錄病毒復制的限制性因子Fv1以及參與到胚胎發育的Syncytins都是選配的逆轉錄病毒基因。但目前對脊椎動物中逆轉錄病毒基因選配事件尚無系統的研究。 韓管助課教授題組在756種脊椎動物基因組中系統地挖掘了逆轉錄病毒基因選配事件，共發現177個逆轉錄病毒選配事件。其中，93個選配事件涉及到逆轉錄病毒gag基因，gag基因選配事件主要發生在哺乳動物和鳥類中。84個選配事件涉及到逆轉錄病毒env基因，env基因選配事件主要發生在哺乳動物、鳥類和魚類中。通過對選配事件發生的時間進行分析，發現選配事件的數目隨著時間的推移而增多，僅有少數的選配的逆轉錄病毒基因在長時間尺度上被維持，這些結果表明逆轉錄病毒基因選配可以在脊椎動物中頻繁的發生和丟失。 一般認為，參與到病毒與宿主間進化軍備競賽的宿主基因會受到正選擇。該研究通過選擇壓力分析在很多選配的逆轉錄病毒基因中發現了正選擇的證據，表明這些基因可能參與到病毒與宿主間進化軍備競賽中。還有部分選配的逆轉錄病毒基因的進化主要受到負選擇，表明這些基因可能主要參與到非抗病毒的宿主功能之中。選配的逆轉錄病毒基因受到不同的選擇壓力表明這些選配的基因可能行使了多種宿主細胞生物學功能。總之，該研究為在脊椎動物進化過程中發生的逆轉錄病毒選配事件提供了一幅全景圖，對全面理解逆轉錄病毒和脊椎動物間互作的進化具有十分重要的意義。
南京師范大學
2021-02-01
成功解析卡波氏肉瘤病毒（KSHV）重要功能蛋白ORF57C端（ORF57-CTD）的單體和二聚體結構
卡波氏肉瘤病毒，又名人類皰疹病毒8型，是一種重要的人類腫瘤病毒，能導致卡波氏肉瘤和B細胞淋巴瘤等惡性腫瘤。ORF57是KSHV編碼的早期基因，在病毒復制過程中能穩定病毒轉錄的mRNA從而促進病毒復制，是病毒裂解復制過程中的重要功能蛋白。ORF57蛋白半衰期較短，因此維持其穩定性對其發揮功能至關重要。既往報道證實ORF57蛋白通過二聚化而得以穩定，然而ORF57二聚化的詳細生化機制長期沒有得到充分的闡明。該研究利用X射線衍射技術成功解析了ORF57-CTD蛋白3.5?分辨率的二聚體結構和3?分辨率的單體結構，揭示了ORF57-CTD每一個單體球狀核心區域底部都含有一個保守的鋅離子CHCC結合序列并結合一個鋅離子；此外，ORF57-CTD的每個單體N端延伸出一個長臂并包裹住另一個單體核心區域，且兩個單體的核心區域以反向平行的形式相互作用。因此，N端長臂和核心區域的相互作用介導了ORF57的二聚化形成
武漢大學
2021-04-10
4分鐘內能檢測到新冠病毒核酸！復旦大學魏大程團隊研發新型檢測方法，未來即測即走或將成為可能
復旦大學高分子科學系魏大程團隊研發出一種新型檢測方法，只需4分鐘，核酸檢測就能出結果。未來核酸檢測，即測即走或將成為可能。
復旦大學
2022-02-17
山東第一醫科大學史衛峰教授團隊在《自然》發文論述新型冠狀病毒的產生、基因組多樣性和全球傳播研究
山東第一醫科大學（山東省醫學科學院）公共衛生與健康管理學院史衛峰教授為本文通訊作者，新發傳染病病因流行病學實驗室李娟博士和英國南安普頓大學賴圣杰博士為共同第一作者。
山東第一醫科大學
2021-12-15
云南生物資源保護與利用國家重點實驗室揭示了馬來穿山甲可能是SARS-CoV-2類似病毒的潛在自然宿主
項目成果/簡介:云南大學省部共建云南生物資源保護與利用國家重點實驗室張志剛團隊于2020年2月2日開始對之前發表的馬來穿山甲病毒組學數據(該數據由2019年3月24日無法救護成功的穿山甲肺的樣本獲取)（Liu et al. 2019, Viruses 11, 979）進行重新組裝和全面系統地分析，發現這批馬來穿山甲攜帶SARS-CoV-2相近的冠狀病毒（命名為Pangolin-CoV），其與SARS-C
云南大學
2021-01-12
省部共建云南生物資源保護與利用國家重點實驗室揭示了馬來穿山甲可能是SARS-CoV-2類似病毒的潛在自然宿主
云南大學省部共建云南生物資源保護與利用國家重點實驗室張志剛團隊于2020年2月2日開始對之前發表的馬來穿山甲病毒組學數據(該數據由2019年3月24日無法救護成功的穿山甲肺的樣本獲取)（Liu et al. 2019, Viruses 11, 979）進行重新組裝和全面系統地分析，發現這批馬來穿山甲攜帶SARS-CoV-2相近的冠狀病毒（命名為Pangolin-CoV），其與SARS-CoV-2和BatCoV RaTG13（武漢病毒所石正麗團隊報道）的基因組相似性分別為91.02%和90.55%。Pangolin-CoV與SARS-CoV-2的親緣關系僅次于RaTG13，但是Pangolin-CoV與SARS-CoV-2的S1功能基序高度一致，涉及與人類ACE2受體互作的五個關鍵氨基酸殘基完全一致，而RaTG13發生了四個突變，提示了Pangolin-CoV與SARS-CoV-2具有相似的宿主細胞識別能力。 新冠肺炎疫情(COVID-19)自2019年底爆發以來，迅速在世界范圍擴散流行，新冠肺炎疫情是由嚴重急性呼吸系統綜合癥冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）引起的，控制COVID-19全球大流行，病毒溯源及其傳播途徑研究是當前的關鍵任務之一。 該研究首次全面澄清了SARS-CoV-2與穿山甲冠狀病毒（Pangolin-CoV）、蝙蝠冠狀病毒（RaTG13）、2003年非典型肺炎冠狀病毒（SARS -CoV）以及2015年中東呼吸綜合征冠狀病毒（MERS-CoV）的關系，認為除了蝙蝠和穿山甲之外，SARS-CoV-2還存在其它未知中間宿主，為進一步攻克病毒源頭和傳播路徑提供了寶貴的參考。同時，該研究也呼吁保護加強野生動物保護和管理，保護野生動物，就是保護人類自己。
云南大學
2021-02-01