“藏族歷史與漢藏關系”研究方向的特點是著力于藏族歷史和漢、藏關系以及西藏地區與中央政權之間內在關聯性的探討，以拓展和深化歷史上西藏地方與中央政權關系的研究，既是基礎性的研究，其成果也為現實服務。

此研究方向涵蓋藏族歷史、宗教、漢藏關系及西藏地方與歷代中央政權關系等眾多領域，分別涉及了歷史學、宗教學、民族學和考古學等學科的理論與方法，其綜合性、交叉性也很強，尤其面對達賴集團的分裂斗爭，此方向具有很強的政治性和很高的學術價值和現實意義。目前我所丹巴繞旦教授承擔的“西藏傳統文化史研究”六個子課題都完成，有六部專著分別于2003年3月和2004年6月由西藏人民出版社正式出版發行，另行兩部國家社科級及項目和校級項目《西藏近現代化發展歷程研究》、《藏族近代文學史》也即將出版發行。除外與此相關的在研國家教育部重點研究基地重大項目有許廣智教授主持的《西藏地方革命與現代化建設研究》、次旦扎西教授主持的《西藏古代地方軍事研究》及強俄巴•次仁央宗主持的《西藏婦女問題研究》等。